❓ 玩法与背景
什么是基因组组装?
测序仪无法一次读完整条基因组,只能产生海量几百碱基长的短片段,称为 reads。生物信息学家通过寻找 reads 之间相同的重叠(overlap)区域,像拼图一样把它们首尾相连,还原出完整基因组——这就是基因组组装(Genome Assembly)。游戏还原的正是其中的“重叠—拼接”核心思想。
拼接规则
- 一条 read 的头部与 contig 尾部(或 read 的尾部与 contig 头部)碱基完全相同,且重叠长度 ≥ 关卡要求的 k,才能拼接。
- 重叠区域在两条 read 上都会高亮显示——现实中它代表测到的同一段 DNA。
- 注意:直接比较相同字母(A 对 A、T 对 T)。A-T / C-G 互补配对是另一回事,本游戏不涉及。
计分
- 放置起点 / 每条 read:+10;每个重叠碱基:+2;通关:+50
- 错误拼接:−3;使用提示:−5(分数最低为 0)
小技巧
盯住 contig 末端最后几个碱基,在手牌里找以这几个字母开头(或结尾)的 read。先拼出长重叠,通常更顺利。